Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CntfrO88507 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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