Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns1O88456 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms