Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme6O88425 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms