Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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