Protein–RNA interactions for Protein: O88245

Gm10139, Mszf85 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10139O88245 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm10139O88245 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm10139O88245 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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