Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cd46O88174 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms