Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SfnO70456 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SfnO70456 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SfnO70456 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SfnO70456 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SfnO70456 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SfnO70456 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SfnO70456 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SfnO70456 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms