Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lnx1O70263 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms