Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgceO70258 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgceO70258 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgceO70258 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SgceO70258 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgceO70258 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgceO70258 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgceO70258 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgceO70258 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgceO70258 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgceO70258 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgceO70258 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SgceO70258 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgceO70258 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgceO70258 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgceO70258 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgceO70258 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgceO70258 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgceO70258 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms