Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alx3O70137 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alx3O70137 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alx3O70137 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alx3O70137 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alx3O70137 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms