Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd70O55237 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms