Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
OtogO55225 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
OtogO55225 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtogO55225 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtogO55225 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
OtogO55225 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtogO55225 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtogO55225 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
OtogO55225 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
OtogO55225 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtogO55225 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtogO55225 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtogO55225 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtogO55225 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtogO55225 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms