Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx4O55187 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms