Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1bO55017 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms