Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SlkO54988 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SlkO54988 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SlkO54988 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SlkO54988 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SlkO54988 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlkO54988 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlkO54988 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlkO54988 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlkO54988 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlkO54988 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SlkO54988 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlkO54988 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlkO54988 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlkO54988 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlkO54988 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlkO54988 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms