Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms