Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pik3cdO35904 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms