Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm44O35857 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm44O35857 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timm44O35857 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms