Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms