Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk3O35492 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk3O35492 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms