Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms