Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smad7O35253 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smad7O35253 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smad7O35253 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smad7O35253 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smad7O35253 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smad7O35253 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smad7O35253 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smad7O35253 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smad7O35253 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smad7O35253 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smad7O35253 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms