Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Neurod4O09105 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms