Protein–RNA interactions for Protein: O09009

Rfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase radical fringe, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfngO09009 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfngO09009 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfngO09009 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RfngO09009 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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RfngO09009 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RfngO09009 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfngO09009 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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RfngO09009 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfngO09009 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfngO09009 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfngO09009 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RfngO09009 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfngO09009 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RfngO09009 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfngO09009 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfngO09009 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfngO09009 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfngO09009 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RfngO09009 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RfngO09009 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfngO09009 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfngO09009 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfngO09009 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfngO09009 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfngO09009 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfngO09009 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfngO09009 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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