Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barx2O08686 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Barx2O08686 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms