Protein–RNA interactions for Protein: O08648

Map3k4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k4O08648 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Map3k4O08648 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Map3k4O08648 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms