Protein–RNA interactions for Protein: O08644

Ephb6, Ephrin type-B receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb6O08644 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ephb6O08644 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb6O08644 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms