Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MttpO08601 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MttpO08601 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MttpO08601 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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MttpO08601 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MttpO08601 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MttpO08601 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MttpO08601 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MttpO08601 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MttpO08601 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MttpO08601 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MttpO08601 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MttpO08601 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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