Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp35M0QWN7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp35M0QWN7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms