Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2888K7N746 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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