Protein–RNA interactions for Protein: K7N6B6

Vmn1r168, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r168K7N6B6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r168K7N6B6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms