Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm28915-201ENSMUST00000189145 699 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms