Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms