Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccer2J3QPU5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms