Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BC024978J3QPC3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BC024978J3QPC3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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BC024978J3QPC3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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BC024978J3QPC3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BC024978J3QPC3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BC024978J3QPC3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BC024978J3QPC3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BC024978J3QPC3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BC024978J3QPC3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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BC024978J3QPC3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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BC024978J3QPC3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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BC024978J3QPC3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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BC024978J3QPC3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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