Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21900J3QP38 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm21900J3QP38 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm21900J3QP38 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm21900J3QP38 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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