Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Gm17577J3QNF7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm17577J3QNF7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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