Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm21972J3QN38 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm21972J3QN38 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm21972J3QN38 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm21972J3QN38 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm21972J3QN38 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm21972J3QN38 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm21972J3QN38 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21972J3QN38 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm21972J3QN38 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Gm21972J3QN38 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gm21972J3QN38 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gm21972J3QN38 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gm21972J3QN38 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gm21972J3QN38 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Gm21972J3QN38 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm21972J3QN38 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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