Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Zfp616J3QN14 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp616J3QN14 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Zfp616J3QN14 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp616J3QN14 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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