Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem200cJ3QK46 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms