Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf148G3X9R7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf148G3X9R7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms