Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc9a3G3X939 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc9a3G3X939 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms