Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r76F8VQ63 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms