Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp32F8VPZ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp32F8VPZ3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms