Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-M1F7CXU4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-M1F7CXU4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-M1F7CXU4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-M1F7CXU4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-M1F7CXU4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-M1F7CXU4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M1F7CXU4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-M1F7CXU4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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H2-M1F7CXU4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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