Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox13F6YCR7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms