Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8444F6XS56 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms