Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17093F6XGJ4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms