Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Zfp988F6VKC7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Zfp988F6VKC7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zfp988F6VKC7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zfp988F6VKC7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zfp988F6VKC7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Zfp988F6VKC7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Zfp988F6VKC7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp988F6VKC7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp988F6VKC7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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