Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngap1F6SEU4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms